La Secretaría General ejecuta los mandatos y delegaciones que le encomienda la Asamblea General, el Consejo Superior y el Comité Directivo. El Secretario(a) General posee la representación general y legal de la FLACSO. Participa en el Consejo Superior y la Asamblea como su Secretario. Sistematiza los informes, presupuestos y rendiciones de cuentas anuales de la FLACSO. Coordina las actividades académicas y de cooperación científica a nivel regional. Realiza gestiones ante las universidades y demás instituciones sociales y culturales, con el objeto de producir convenios de naturaleza académica. Registra y confiere, junto con las unidades académicas, los títulos de postgrado. La Secretaria General para el periodo 2016-2024 es la doctora Josette Altmann Borbón. La Secretaría General de la FLACSO se encuentra ubicada en San José, Costa Rica.

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Sitio web: www.flacso.org 

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